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2017年度 ニュース一覧

2018/3/27～29

第９１回日本細菌学会総会に参加し，口頭発表を行いました。
　　　

修士二年　山本尚輝
大腸菌LdhA発現によるpersister形成メカニズムの解明

　　　

2018/3/2

第６回日本生物学会東日本支部コロキウムに参加し，口頭発表を行いました。
　　　

修士二年　山本尚輝
確率的な ldhA発現による大腸菌persister形成

　　　日本生物工学会東日本支部長賞受賞 　　　

2018/1/20

B3歓迎会を開催しました！
新しいメンバーと一緒に研究も頑張っていきましょう！
これからよろしくお願いします。

17/12/12-14

第46回日本免疫学会学術集会に参加し，口頭発表とポスター発表を行いました。
　　　

修士二年　嘉悦茉優
　　　　ポスター発表
Colonic inflammation induces a transient increase in serum LECT2 level

　　　

　　　
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17/11/17

2017年日本細菌学会関東支部インターラボセミナーに参加し，口頭発表を行いました。
　　　

修士二年　山本尚輝
ldhA発現による大腸菌persister形成と好気代謝制御との関係

　　　

17/11/10-11

日本生物工学会東日本支部第12回学生発表討論会に参加し，口頭発表を行いました。
　　　

修士一年　菊池脩太
新規なアンモニア酸化細菌 Nitrosomonas sp. PY1のゲノム解析

　　　

修士一年　吉山千尋
バイオフィルム中に存在する非分裂細菌の抗生物質寛容性の評価

　　　
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17/10/20-22

第79回日本血液学会学術集会に参加し，ポスター発表を行いました。
　　　

修士二年　眞野修一
家族性骨髄増殖性腫瘍患者からのiPS細胞株の樹立

　　　
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2017/9/11-14

第69回日本生物工学会大会に参加し，ポスター発表を行いました。

博士一年　大田悠里
water-in-oil エマルションを用いた微生物培養技術の開発

　　　

修士二年　山本尚輝
大腸菌の乳酸発酵遺伝子ldhA発現によるpersister形成とプロトン駆動力との関係

　　　
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2017/9/6-8

How dead is dead? V (HDID V)に参加し，口頭発表を行いました。

博士四年　宮本龍樹
Characterization of a chromosomal toxin-antitoxin module conserved in Nitrosomonas europaea

また、ポスター発表を行いました。
　　　

博士三年　河合祐人
Fermentation pulse expression leads to formation of E. coli persister

　　　

博士一年　千原康太郎
Spatio-temporal dynamics of dormant cells in Pseudomonas aeruginosa biofilms based on bacterial growth activity

　　　
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17/8/29-31

環境微生物系学会合同大会2017に参加し，ポスター発表を行いました。

博士四年　宮本龍樹
硝化細菌におけるストレス応答機構の解明: Toxin-antitoxin機構はなぜ必要 なのか？

博士三年　河合 祐人
persister形成メカニズムに対する培養環境の影響

博士一年　一色 理乃
硝化菌単一菌株集団でみられる形態と増殖能の不均一性

修士二年　山本 尚輝
ldhA発現による大腸菌persister形成と中心代謝経路の関係

修士一年　野町 真名実
完全アンモニア酸化能を保持するComammox細菌の分離培養と生理生態

なお、以下の発表ではポスター賞を受賞しました。

博士一年　千原 康太郎
細菌の分裂活性をもとにした緑膿菌コロニーバイオフィルム内の休止細菌時空 間動態の解析

　　 　

修士二年　石井拳人
ゲノムから推定する遅増殖性Nitrotogaの活性促進因子 　　　
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17/7/23-27

5th International Conference on Nitrificationに参加し，ポスター発表を行いました。

次席研究員　藤谷拓嗣
Comparative genomics of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from activated sludge

博士一年　一色理乃
Growth heterogeneity in pure cultures of nitrifiers

　　 　

修士二年　石井拳人
Genome-informed isolation of nitrite oxidizer Nitrotoga sp.

　　　
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2017/7/9-13

7th Congress of European Microbiologistsに参加し，ポスター発表を行いました。
　　　
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2017/7/7-8

第31回日本バイオフィルム学会に参加し，口頭発表を行いました。

修士二年　山本尚輝
ldhA発現を介したpersister形成とプロトン駆動力との関係

また、ポスター発表を行いました。なお、この発表でポスター賞を受賞しました。
　　　

修士一年　吉山千尋
バイオフィルムを形成する細菌の増殖速度と抗生物質抵抗性

　　　
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2017/6/15-16

第21回腸内細菌学会に参加し，口頭発表とポスター発表を行いました。

修士一年　森美穂乃
離乳前の腸内細菌叢の撹乱が腸管炎症制御におよぼす影響解析

　　　

招聘研究員　大坂 利文
離乳前の腸内細菌叢攪乱が食物アレルギー感受性に与える影響解析

　　　
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2016年度 ニュース一覧

2016/3/23-25

第90回日本細菌学会総会に参加し，口頭発表を行いました。

教授　常田聡
不均一性細菌学：表現型の不均一性に基づいた細菌の生存戦略

　　　

博士二年　河合佑人
ldhA 遺伝子の確率的な発現による大腸菌の persister 形成

また，ポスター発表を行いました。

修士二年　一色理乃
なぜ，難培養性微生物の増殖は不均一なのか？―シングルセル観察から見えたクローナル集団の実態―

修士二年　千原康太郎
乳酸脱水素酵素阻害による緑膿菌バイオフィルム除去

修士一年　山本尚輝
好気呼吸と発酵のバランスが崩れると persister が形成される

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2017/ 3/4

第19回化学工学会学生発表会(小金井大会)に参加し,口頭発表を行いました。

学部四年　菊池脩太
乳幼児期の腸内細菌叢攪乱がアレルギー応答に与える影響解析

学部四年　野町 真名実
革新的分離培養技術による新規なcomammox細菌の獲得と生存戦略の解明

　　　

学部四年　吉山 千尋
緑膿菌バイオフィルム中に存在する非分裂細菌の生理学的機能解明

学部四年　森 美穂乃
乳幼児期の腸内細菌叢の撹乱が腸管炎症の抑制的制御機構に与える影響解析

　　　　
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2017/ 3/2-4

第11回日本ゲノム微生物学会年会に参加し，口頭発表とポスター発表を行いました。

口頭発表

博士三年　牛木章友
Nitrospiraの亜硝酸酸化活性を制御するQuorum-sensing機構の発見

ポスター発表

修士一年　石井拳人
セルソーターによって分取された凝集体内の微生物間相互作用の解明

　　　　
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2017/ 3/2

第5回日本生物工学会東日本支部コロキウムに参加し,ポスター賞を受賞しました。

修士一年　山本尚輝
確率的なldhA発現に伴うpersister形成のメカニズム解明

　　　　
　 　　

2017/1/14

B3歓迎会を開催しました！
新しいメンバーと一緒に研究も頑張っていきましょう！
これからよろしくお願いします。

2016/ 12/5-7

第45回日本免疫学会学術集会に参加し,ポスター発表を行いました。

修士二年　上田統悟
The interaction between commensal bacteria and innate immune cells regulates acute colitis

　　　　
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2016/ 10/22-25

第31回日本微生物生態学会に参加し，ポスター発表を行いました。

博士二年　河合祐人
大腸菌のpersister形成を誘導する多様な経路

　

修士二年　一色理乃
クローナルな硝化菌集団における細胞増殖活性の不均一性の評価と機構解明

　

修士一年　石井拳人
微生物凝集体ソーティングによる未培養な亜硝酸酸化細菌Nitrotogaの獲得と生存戦略

　

修士一年　島田　侑
Quorum-sensing機構による亜硝酸酸化細菌Nitrospira japonicaの活性制御メカニズム

　

修士一年　山本尚輝
ldhAの確率的な発現によるpersister形成と制御

　　　　
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2016/10/1-2

ゼミ合宿を開催致しました！

今年は山梨に行きました。ほうとう作り，昇仙峡ハイキング, 洞窟探検, ぶどう狩りなどを経て一層親睦が深まりました！

2016/ 9/28-30

第68回日本生物工学会大会に参加し, ポスター発表を行いました。

博士一年　大田悠里
病原性微生物を対象としたプログラム細胞死誘導物質の探索

　　　　
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2016/9/4-7

デンマークで開催された6th International Conference Microbial Ecology and Water Engineeringに参加し, ポスター発表を行いました。

次席研究員　藤谷拓嗣
Ammonia concentration determines ecological niche differentiation of Nitrospira as nitrite-oxidizers in activated sludge

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2016/8/21-26

カナダで開催された16th International Society for Microbial Ecologyに参加し, 口頭発表とポスター発表を行いました。

口頭発表

次席研究員　藤谷拓嗣
Direct isolation of microcolonies from activated sludge opens the window of unrecognized genus Nitrosomonas as ammonia oxidizers

博士三年　牛木章友
Comparative genomic analysis of phylogenetically distinct two Nitrospira strains isolated from a wastewater treatment plant

ポスター発表

博士四年　Soe Myat Thandar
Physiological and genetic properties of Nitrosomonas mobilis Ms1 isolated from autotrophic nitrifying granule of wastewater treatment plant

修士一年　石井拳人
Physiological characterization of Nitrotoga-like bacteria enriched from coastal sand

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2016/ 7/30

2016年度生命医科学科ポスター交流会に参加し, 最優秀ポスター発表賞を受賞しました。

修士二年　千原康太郎

2016/7/2

第30回 日本バイオフィルム学会学術集会に参加し，口頭発表を行いました。

博士二年　河合祐人
嫌気代謝遺伝子の発現ノイズによるPersister形成の解析

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2016/7/1

第1回バイオフィルム研究者若手ワークショップに参加し，ポスター発表を行いました。

修士二年　千原康太郎
バイオフィルム中の休?細菌の動態解析

2016/6/13-14

環境バイオテクノロジー学会２０１６年度大会に参加し，口頭発表を行いました。

次席研究員 藤谷拓嗣
新規な分離培養技術によって獲得された硝化細菌の生理・ゲノム特性

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2016/6/9-10

第20回腸内細菌学会に参加し、口頭発表を行いました。

招聘研究員　大坂 利文
核内受容体 FXR を活性化する腸内細菌の探索

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2015年度 ニュース一覧

2016/3/27-30

日本農芸化学会2016年度大会に参加し，招待講演を行いました。

助手　藤谷拓嗣
新規な分離培養戦略が切り拓く難培養性硝化細菌の獲得と生理・ゲノム特性

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2016/3/23-25

第89回日本細菌学会総会に参加し，口頭発表を行いました。

教授　常田聡
遺伝子発現解析とシングルセル観察から探るDormant Persistersの正体

また，ポスター発表を行いました。

博士一年　河合佑人
ストレス環境が誘導する大腸菌休止化経路の解析

ポスター最優秀賞受賞

修士一年　千原康太郎
三次元数理シミュレーションを利用したバイオフィルム中の休止細菌形成動態の解析

修士一年　一色理乃
細胞集団中の確率的なIdhA発現による休止細菌形成

修士一年　上田統悟
常在細菌―TLRsの相互作用を介した腸管炎症制御機構

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2015/1/16

B3歓迎会を開催致しました！
新しいメンバーと一緒に研究も頑張っていきましょう！
これからよろしくお願いします。

2015/11/13-14

日本生物工学会東日本支部 第10回学生発表討論会に参加し，口頭発表を行いました。

修士一年　一色理乃
シングルセルレベルでのldhA発現のゆらぎと休止細菌形成

2015/10/17-20

第30回日本微生物生態学会大会に参加し、口頭発表およびポスター発表を行いました。

助手　藤谷拓嗣
Isolation, physiology, and genomics of novel nitrifiers

博士三年　Soe Myat Thandar
Physiological characterization of Nitrosomonas mobilis-like strain isolated from autotrophic nitrifying granule

博士二年　牛木章友
比較ゲノム解析が明らかにする亜硝酸酸化Nitrospiraの生態学的ニッチ

修士二年　安部拓磨
活性汚泥中に潜在する未培養アンモニア酸化細菌の分離培養

修士二年　大田悠里
ファージディスプレイ法によるプログラム細胞死誘導物質の探索

　　　　　

修士一年　一色理乃
シングルセルレベルでのldhA発現のゆらぎと休止細菌形成の関連性

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2015/10/3-4

ゼミ合宿を開催致しました！

今年は那須塩原に行きました。茶臼山登山，BBQ，そば打ち体験を経て一層親睦が深まりました！

2015/7/10-11

第29回日本バイオフィルム学会に参加し，口頭発表を行いました。

博士一年　河合祐人
遺伝子発現から探る休止細菌の分子機構

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2015/6/28-7/1

4th International Conference on Nitrificationに参加し，最優秀ポスター発表賞を受賞しました。

助手　藤谷拓嗣
Isolation and successful subculture of Nitrosomonas mobilis lineage: Recovery of nature's lost treasure since 1970's

また，ポスター発表を行いました。 　　　　　

博士三年　籾内研吾
Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and Nitrospira from freshwater by continuous feeding bioreactors

博士二年　牛木章友
Comparative genomic analysis of phylogenetically distant two Nitrospira strains isolated from a WWTP

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2015/6/29

環境バイオテクノロジー学会2015年度大会に参加し、口頭発表を行いました。

修士二年　安部拓磨
新規分離培養手法を用いたハイスループットなアンモニア酸化細菌の獲得

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2015/6/18

第19回腸内細菌学会に参加し、口頭発表を行いました。

修士一年　上田統悟
腸管炎症制御に関する常在細菌―TLRsの相互作用

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2015/6/7-11

オランダで開催された6th Congress of European Microbiologistsに参加し，ポスター発表を行いました。

博士二年　宮本龍樹
The identification method for the sequence pattern at the cleavage sites of mazF family endoribonucleases using massive parallel sequencing

博士一年　河合祐人
Molecular mechanism analysis of persisters formation with a cell division marker

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2014年度 ニュース一覧

2015/3/26-28

第88回日本細菌学会総会に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

招聘研究員　大阪利文
The physiological importance of commensal Enterobacteriaceae populations in the gut homeostasis

博士三年　張先琴
The interaction between host and commensal bacteria through the farnesoid X recepter

修士二年　河合祐人
細菌の休止状態に関係する遺伝子発現の網羅的解析

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2015/2/18-19

B3歓迎会も兼ねてスノボ合宿に行きました！

2015/1/17

B3歓迎会を開催致しました！
新しいメンバーと一緒に研究も頑張っていきましょう！
これからよろしくお願いします。

2014/11/7-8

日本生物工学会東日本支部 第９回学生発表討論会に参加し，口頭発表を行いました。

修士一年　安部拓磨
難培養性微生物を標的とした網羅的・高速ハンティング

修士一年　大田悠里
Toxin-Antitoxin結合阻害剤の探索

2014/11/4-7

台湾で行われた7th World Congress on Preventive & Regenerative Medicineに参加し，口頭発表を行いました。

修士一年　日向裕人
The effective of low temperature cultivation(LCT) for tissue engineering

修士一年　菅野光祐
The assessment of aligned murine skeltal muscle cell sheet

2014/10/31-11/2

第76回日本血液学会学術集会に参加し，口頭発表を行いました。

修士二年　竹井拓
MPLW515L/K変異の新規検出・定量手法の確立

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2014/10/30

城塚杯に参戦してきました！
総合順位は3位でした。次回は優勝できるように頑張ります！
選手の皆様お疲れ様でした！

2014/10/21-24

浜松で行われた環境微生物系学会合同大会に参加し，ポスター発表を行いました。

博士一年　牛木章友
nxrBを標的としたin situ RCA-FISH法による亜硝酸酸化細菌の探索

修士二年　熊谷麻美
難培養性アンモニア酸化細菌Nitrosomonas mobilisの分離培養と生理学的性質の解明

修士一年　神野大
比較解析から迫る亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの生態学的ニッチ

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2014/9/11

札幌で行われた日本生物工学会大会に参加し，ポスター発表を行いました。

修士二年　森山恵里
腸炎の寛解誘導に関わる腸管内細菌代謝物動態の解析

修士一年　鎌田瑞翔
抗炎症を有する腸内細菌のスクリーニングとその作用機序の解明

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2014/8/24-29

韓国で行われた15th International society for microbial ecology (ISME15)に参加し，ポスター発表を行いました。

助手　藤谷拓嗣
Selective inoculation of microcolonies materializes cultivation and isolation of previously uncultured nitrifying bacteria

博士二年　籾内研吾
Selective enrichment of uncultured ammonia-oxidizing bacteria and archaea and nitrite oxidizing bacteria from freshwater

博士一年　牛木章友
Detection of nxrB genes by in situ RCA-FISH to identify unrecognized nitriteoxidizing microorganisms in environments

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2014/8/9

生医ポスター交流会に参加し，最優秀発表賞を受賞いたしました。

修士二年　太田悠木
大腸腫瘍における腺管構造異常のシステム的理解

また，ポスター発表を行いました。

修士二年　熊谷麻美
難培養性アンモニア酸化細菌の分離培養と生理学的性質の解明

修士二年　河合祐人
休止細菌の分子機構解析

修士一年　鎌田瑞翔
抗炎症を有する腸内細菌のスクリーニングとその作用機序の解明

修士一年　神野大
比較解析から迫る亜硝酸酸化細菌Nitrospiraの生態学的ニッチ

修士一年　日向裕人
厚い血管網付き3次元心筋組織構築に向けた低温培養の基礎検討

2014/8/8

納涼会を開催しました！
今年も非常に賑やかな会となりました＾＾
まだまだ暑い日が続きますが、暑さに負けずに頑張りましょう！

2014/6/11-12

第18回腸内細菌学会に参加し，口頭発表を行いました。

招聘研究員　大坂利文
腸内細菌による腸管上皮バリア機能の強化・修復

修士一年　鎌田瑞翔
腸内細菌代謝産物を介した大腸上皮細胞の炎症応答抑制機構の探索

2014/5/30

B4・M2の内定・Doctor進学祝いを開催いたしました！

ご卒業される方は残り短い研究室生活もみんなで楽しく過ごしましょう！

Doctorに進学される方は今後とも，ご指導よろしくお願いします！

2014/5/9

日本水環境学会主催の国際会議Water and Environment Technology 2014(WET2014)が 6/28-29にTWInsで開催されます(実行委員長: 常田聡)。

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2013年度 ニュース一覧

2014/3/4-6

第13回日本再生医療学会総会に参加し、口頭発表を行いました。

次席研究員　加川友己
微小ガラス電極を用いた酸素計測によるヒトiPS細胞由来心筋細胞の動態評価

修士二年　前山絵里奈
効率的な酸素供給を実現する新規培養手法の構築

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2014/3/4

【東日本支部】第2回日本生物工学会東日本支部コロキウムに参加し、日本生物工学会東日本支部長賞を受賞しました。

修士二年　宮本龍樹

また、ポスター発表を行いました。

学部四年　鎌田瑞翔
腸内細菌による大腸上皮細胞の炎症制御

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2014/2/19-20

B3歓迎会も兼ねてスノボ合宿に行きました！

2014/1/18

B3歓迎会を開催致しました！
新しいメンバーと一緒に研究も頑張っていきましょう！
これからよろしくお願いします。

　

2013/12/21

忘年会を開催致しました！OBの方もたくさんいらして下さり今年を締めくくる楽しい会となりました。
2014年もがんばってがんばっていきましょう！

2013/12/11-13

第42回日本免疫学会学術集会（千葉）に参加し、発表を行いました。

助教　大坂利文
The role of gut microbiota in the progression of non-alcohol fatty liver disease

博士五年　謝鎮宇
The Regulation of the Intestinal Epithelial Tight Junction Protein by Bifidobacterium bifidum.

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2013/12/7

第19回Hindgut club Japanシンポジウムに参加し、ポスター発表を行いました。

助教　大坂利文
腸管上皮バリア機能の強化・修復を担う腸内細菌の探索

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2013/12/7-8

2013年度バイオフィルムと複合系研究会に参加し、ポスター発表を行いました。

修士一年　河合祐人
休止細菌の分子機構解析

修士一年　宮川聡史
バイオフィルム中の休止細菌の時空間ダイナミクスの解析

学部四年　安部拓磨
排水処理槽に生息するポリリン酸蓄積細菌の分離培養

学部四年　神野大
水環境から単離された亜硝酸酸化細菌の比較解析

2013/11/23-25

第29回日本微生物生態学会大会に参加し、口頭発表およびポスター発表を行いました。

助手　藤谷拓嗣
亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした新規分離培養手法と他の難培養性微生物への適用

博士一年　籾内研吾
低濃度アンモニアの連続供給による難培養性硝化微生物の選択的集積培養

修士二年　牛木章友
機能遺伝子nxrBに基づく新規な亜硝酸酸化細菌の探索

修士二年　北川真衣
環境中に潜在するAnammox細菌の集積培養と群集構造解析

修士一年　入江香菜
「個」と「集団」で生きる微生物たちを分ける

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2013/11/22-24

定量生物学の会第6回年会に参加し、ポスター発表を行いました。

修士二年　村野享正
マウス結腸陰窩細胞動態の三次元モデルの構築

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2013/11/9-10

第16回日本水環境学会シンポジウムに参加し、口頭発表を行い、博士研究奨励賞（オルガノ賞）を受賞致しました。

助手　藤谷拓嗣
難培養性亜硝酸酸化細菌Nitrospiraを標的とした革新的分離培養戦略

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2013/10/26

常田先生のお誕生会を行いました！先生、おめでとうございます。みんなでケーキもおいしくいただきました。

2013/10/19

ミャンマーから留学にきたソーさんの歓迎会を行いました。研究室の仲間としてこれからよろしくお願いします。

2013/9/18-20

第65回日本生物工学会大会に参加し、ポスター発表を行いました。

博士三年　古田篤史
長波長蛍光標識RNAプローブを用いたC型肝炎ウイルスNS3 helicaseの新規な活性測定手法

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2013/9/18-20

ゼミ合宿を開催致しました！

今年は洞爺湖でのサンプリングもかねて北海道のニセコに行きました。
大自然の中、パークゴルフや野菜収穫、料理対決を行い、一層親睦が深まりました。

2013/9/9-12

EUROBIOFILMS 2013に参加し、口頭発表とポスターを行いました。

特別研究員　松本慎也
In situ identification of persisters by visualizing Z-ring formation

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2013/9/2-5

3rd International Conference on Nitrificationに参加し、ポスター発表を行いました。

助手　藤谷拓嗣
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured nitrifying bacteria

修士二年　牛木章友
Comparative physiological analysis of /i/Nitrospira/i/ strains isolated from a wastewater treatment plant

修士二年　北川真衣
Molecular analysis of enrichment cultures of freshwater anammox bacteria

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2013/8/10

納涼会を開催致しました！

今年は東京湾の花火大会に行きました。
とても眺めの良い場所から花火が見れて楽しかったです。

2013/8/9

TWInsポスター交流会に参加し，最優秀発表賞を受賞いたしました。

修士一年　宮川聡史
緑膿菌のバイオフィルム形成における休止細菌の解析

また、ポスター発表を行いました。

修士二年　岩元由佳
細菌マイクロクラスターの形成に関与する物質の同定

修士一年　入江香菜
微生物凝集性に着目した微生物のスクリーニング 　

　

修士一年　竹井拓
骨髄増殖性腫瘍におけるMPLW515L/K変異の高感度検出・定量技術の開発 　

　

修士一年　森山恵里
腸炎の寛解誘導に関わる細菌と腸上皮のクロストークの解明 　

2013/8/3-4

第17回酸素ダイナミクス研究会に参加しました。

次席研究員　加川友己
局所酸素濃度計測による心筋細胞の機能評価

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2013/7/7-10

5th International Conference Microbial Ecology and Water Engineering 2013に参加し，Best Poster Awardを受賞いたしました。

助手　藤谷拓嗣
An innovative cultivation and isolation strategy for uncultured Nitrospira

また、一般講演を行いました。

教授　常田聡
Mathematical Modeling for the Nutrient Removal Process with Growth of Microbial Granules

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2013/7/1

D3、M2の進路内定祝いを開催致しました！

みなさん無事に決まって良かったです。
卒業後は社会に出られる先輩もいらっしゃいますが、今後も卒業までの間宜しくお願いします。

2013/6/13-14

Water and Environment Technology & Conference 2013に参加し、Research awardを受賞いたしました。

特別研究員　松本慎也
Applicability of a sequencing batch membrane biofilm reactor for simultaneous nitrogen and phosphorus removal from low C/N ratio wastewater

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2013/6/13-14

第17回腸内細菌学会に参加し、優秀発表賞を受賞いたしました。

助教　大坂利文
腸内細菌代謝産物を介した大腸上皮細胞の炎症応答抑制

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2013/6

日本水環境学会より平成24年度論文賞を受賞いたしました。

教授　常田聡
Formation of nitrifying granules using a continuous stirred-tank reactor

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2013/6/2

日本細菌学会「若手研究者によるバイオフィルム研究ワークショップ」に参加し，口頭発表を行いました。

特別研究員　松本慎也
細菌の細胞分裂活性を指標としたdormant persister cellの解析

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2013/4/20

-Cell Symposia: Microbiome and Host Healthに参加し，ポスター発表を行いました。

助教　大坂利文
The interaction between commensal bacteria and innate immune receptors for modulating the intestinal inflammaatory response

2013/4/20

-TWIns 5周年記念-東京女子医科大学・早稲田大学ジョイントシンポジウムに参加し，ポスター発表を行いました。

博士一年　籾内研吾
淡水環境に生息する難培養性硝化細菌の新規分離培養手法の開発

修士一年　宮川聡史
細菌バイオフィルム中の休止細菌の解析 　

2012年度 ニュース一覧

2013/3/23

謝恩会・送別会を開催致しました！
同時に佐野さんのお別れ会も行いました！
就職なさるM2の先輩方と佐野さんとは最後の会でしたが、楽しい思い出が出来ました！
先輩方の今後のご活躍をお祈り致します。
またぜひ常田研に遊びに来て下さい！お待ちしています！

2013/3/18-20

第12回日本再生医療学会総会に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

次席研究員　加川友己
ラットおよびヒトiPS細胞由来心筋細胞の局所酸素濃度に応じた代謝動態

修士二年　中山悠衣
灌流培養バイオリアクタを用いた血管網付きヒト心筋組織の構築

修士一年　前山絵里奈
心臓を構成する各種細胞の酸素消費速度の測定

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2013/3/18-20

第86回日本細菌学会総会に参加し，優秀発表賞を受賞いたしました。

学部四年　宮川聡史
Pseudomonas aeruginosa PAO1のバイオフィルム形成における休止細菌の時空間ダイナミクスの解析

また、一般講演およびポスター発表を行いました。

修士一年　岩元由佳
細菌の分裂活性に基づいたdormant persisterの新規マーカーの開発

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2013/3/16

ストレス応答制御に基づく次世代型健康寿命科学の研究拠点形成の第一回成果報告会に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

教授　常田聡
腸内細菌と粘膜免疫系との相互作用による炎症反応の制御

博士四年　謝陳宇
Repairing of TNF-a induced intestinal epithelial TJ dysfunction by Bifidobacterium bifidum isolated from normal individual

学部四年　森山恵里
DSS腸炎の病態形成に関わる腸内環境因子の探索

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2013/3/14

ホワイトデー飲み会を開催致しました！
毎年恒例の行事になりそうな飲み会ですが、
より仲を深められたのではないでしょうか笑
B3も溶け込めたようで、楽しいひと時を過ごしました！

2013/3/11-13

第47回水環境学会年会に参加し，口頭発表を行いました。

修士二年　籾内研吾
淡水環境に生息する難培養性硝化細菌の新規分離培養手法の開発

2013/1/21

B3歓迎会を開催致しました！
今年も6名の新しい仲間が加わり、より一層研究活動に励んでいきたいと思います。
とりあえず、みんな仲良くしましょう！
これからよろしくお願いします。

2012/12/22

忘年会を開催致しました！
今年は全員参加で、OBの方も参加してくださり賑やかなものになりました。
一年間あったことを噛み締め、2013年もがんばっていきたいと思います！

2012/12/8

第18回Hindgut club Japanシンポジウムに参加し，ポスター発表を行いました。

修士一年　和湯千紘
腸管炎症制御に関わる細菌-自然免疫細胞の相互作用の解明

学部四年　森山恵里
腸炎の病態形成に関わる腸内環境因子の探索

2012/12/5-7

第41回日本免疫学会学術集会に参加し，ポスター発表を行いました。

博士三年　謝鎮宇

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2012/11/24-25

第5回定量生物学の会年会に参加し，ポスター発表を行いました。

修士一年　村野享正
結腸上皮細胞アポトーシス動態が細胞腫ごとに異なるという予測の検証

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2012/11/9-10

日本生物工学会東日本支部第7回学生発表討論会に参加し，口頭発表を行いました。

修士一年　牛木章友
難培養を克服するSIMic（Selective Inoculation of Microcolony）法の開発

修士一年　宮本龍樹
RNA干渉酵素を用いたRNAの配列特異的な切断技術の開発

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2012/10/20-21

ゼミ合宿を仙石原in神奈川県箱根市にて開催いたしました！
料理対決やパターゴルフ対決、寄木細工体験などを通じて、
普段は違う研究班の人との親睦を深めました！

2012/10/13-14

2012年度バイオフィルムと複合系研究会に参加し，ポスター発表賞金賞を受賞いたしました。

修士一年　岩元由佳

また、一般講演およびポスター発表を行いました。

特別研究員　松本慎也　(一般講演)

修士二年　籾内研吾　(ポスター)

修士一年　牛木章友　(ポスター)

学部四年　入江香菜　(一般講演)

2012/9/29

第16回酸素ダイナミクス研究会に参加し，口頭発表を行いました。

次席研究員　加川友己
心筋細胞シートにおけるエネルギー代謝

修士一年　前山絵里奈
単層培養系における局所酸素濃度の測定

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2012/9/26

張さんの歓迎会を開催致しました！
中国から博士課程へ入学されました。
うまく英語が話せるか不安ですが笑、皆仲良くしましょう！
張さん、これから宜しくお願いします！

2012/9/19-22

第28回日本微生物生態学会大会、第4回日韓微生物生態シンポジウムに参加し，ポスター優秀賞を受賞いたしました。

博士四年　藤谷拓嗣
Isolation of previously uncultured Nitrospira unveils the physiology of nitrite-oxidizing bacteria in wastewater treatment process
難培養性Nitrospiraの単離が排水処理プロセスでの亜硝酸酸化細菌の生理学的性質を明らかにする

また、招待講演およびポスター発表を行いました。

教授　常田聡　(招待講演)
Microbial community design for environmental purification using systematic methodology
システム論的アプローチによる環境浄化微生物コミュニティーデザイン

招聘研究員　青井議輝　(招待講演)
Development of new technologies for cultivation of uncultureables
培養できない微生物を培養するための新規技術開発

修士一年　宮本龍樹　(ポスター)
Development of a novel method for sequence-specific RNA cleavage using mRNA interferases
mRNA interferaseを用いたRNAの配列特異的な切断技術の開発

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2012/9/5-8

3rd TERMIS World Congress 2012に参加し，ポスター発表を行いました。

次席研究員　加川友己
Metabolic change of cultured cell sheets depending on oxygen supply

修士二年　中山悠衣
Vascularized tissue fabrication from human cells using in vitro bioreactor

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2012/8/19-24

14th International society for microbial ecology (ISME14)に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

招聘研究員　青井義輝
New cultivation methods accessing unculturables and puzzling out unculturability

特別研究員　松本慎也
Computational modeling of microbial granulation processes for wastewater treatment

助教　大坂利文
Host-microbes interplay involved in the resolution of intestinal inflammation

博士四年　藤谷拓嗣
Novel method for uncultured nitrifying bacteria

修士二年　籾内研吾
Selective cultivation of nitrifying bacteria present in drinking water treatment plants

修士一年　牛木章友
Comparative physiological analysis of previously uncultured Nitrospira strains isolated from wastewater treatment plants

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2012/8/11

納涼会を開催致しました！
今回は昨年OBの方も呼び、賑やかな会となりました＾＾
まだまだ暑い日が続きますが、
暑さに負けずに頑張りましょう！

2012/6/14

第16回　腸内細菌学会に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

助教　大坂利文
DSS腸炎マウスの病態形成過程における腸内細菌由来TLRs刺激能の動態

修士二年　松浦諒
大腸上皮細胞を用いた炎症応答抑制に関わる腸内細菌の探索

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2012/6/12

第11回　日本再生医療学会総会に参加し，口頭発表およびポスター発表を行いました。

次席研究員　加川友己
培地・酸素供給の変化に応じた細胞シートの代謝変動特性

修士二年　中山悠衣
生体外における血管網付ヒト三次元組織の構築

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2012/5/26

第3回　日本血液学会(JSH)国際シンポジウムに参加し，ポスター発表を行いました。

修士一年　高橋廣智
Clinical Relevance of JAK2 V617F Somatic Point Mutation in Japanese Myeloproliferative Neoplasm Patients

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2012/5/17

日本組織培養学会　第85回大会に参加し，口頭発表を行いました。

次席研究員　加川友己
細胞シート積層による三次元心筋組織構築過程における代謝評価

修士一年　前山絵里奈
再生医療に用いる細胞シートのエネルギー代謝

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2012/5/17

M2進路内定祝いを開催致しました！
全員無事に決定し、本当に良かったです。
来年度からはそれぞれの道に進まれますが、
少なくともあと一年程ありますので、引き続き宜しくお願い致します！

2012/4/12

崔さんの送別会を開催致しました。
穏やかで優しい崔さんがいなくなってしまって、非常に寂しいです…。
またいつでも、常田研に遊びにいらしてください！
崔さんのこれからのご活躍をお祈り申し上げます。